我國主計制度創立於民國20年，因獨特的歷史背景和長年累積之經驗，發展出現行從中央政府到地方政府一條鞭的超然主計制度，兼採集中制與分散制之長，一方面主計事務集中管理，以行政院主計總處為全國最高主計機關，掌理全國歲計、會計及統計事項，並制定主計法規、制度與方法，供為全國各級主計機關(構)共同遵循；另主計業務分別由中央所屬各機關(包括總統府、五院及行政院所屬各一級機構)、各級地方政府(包括直轄市、縣(市)及鄉鎮市公所)分別設置專責主計機關(構)，以負責辦理所在機關之歲計、會計及統計業務。

　　各級主計人員之任免遷調，在中央各主管機關及直轄市、縣(市)政府之主辦主計人員，由行政院主計總處檢討核派，其餘由各該管主計機構層報行政院主計總處核辦，或依授權規定逕行核派。各級主計主辦人員，除依法受所在機關長官之指揮外，並對各該管上級機關主辦人員負責；是以，主計制度具有3項超然特質：分別為一、主計機構組織超然於機關之外，另成一主計行政系統；二、主計人員職位超然，不因機關首長之異動而更動；三、主計業務超然，主計人員可超然獨立行使其職務，不受任何影響。

　　全國主計機構系統圖如下：